Acetobacter sicerae

Cinq isolats de bactéries acétiques, awK9_3, awK9_4 (= LMG 27543), awK9_5 (= LMG 28092), awK9_6 et awK9_9, obtenus au cours d'une étude de micro-organismes présents dans le kéfir de production traditionnelle, ont été regroupés sur la base de leur MALDI-TOF Profil MS avec LMG 1530 et LMG 1531 (T), deux souches actuellement classées comme membres du genre Acetobacter. Une analyse phylogénétique basée sur des séquences géniques presque complètes de l'ARNr 16S ainsi que sur des séquences partielles concaténées des gènes de ménage dnaK, groEL et rpoB a indiqué que ces isolats étaient des représentants d'une seule nouvelle espèce avec LMG 1530 et LMG 1531 (T) dans le genre Acetobacter, avec Acetobacter aceti, Acetobacter azoteifigens, Acetobacter oeni et Acetobacter estunensis comme voisins phylogénétiques les plus proches. La similarité par paire des séquences géniques de l'ARNr 16S entre LMG 1531 (T) et les souches types des espèces susmentionnées était de 99,7%, 99,1%, 98,4% et 98,2%, respectivement. Les hybridations ADN-ADN ont confirmé ce statut, alors que les données du polymorphisme de longueur de fragment amplifié (AFLP) et de l'ADN polymorphe amplifié aléatoire (RAPD) indiquaient que LMG 1531 (T), LMG 1530, LMG 27543 et LMG 28092 représentaient au moins deux souches différentes du roman espèce. L'acide gras principal de LMG 1531 (T) et de LMG 27543 était C18: 1ω7c. La principale ubiquinone présente était la Q-9 et les teneurs en ADN G + C de LMG 1531 (T) et de LMG 27543 étaient respectivement de 58,3 et 56,7% en moles. Les souches ont pu croître sur du D-fructose et du D-sorbitol en tant que source de carbone unique. Ils ont également pu croître sur des extraits de levure contenant 30% de D-glucose et sur un milieu standard de pH 3,6 ou contenant 1% de NaCl. Ils avaient une faible capacité à produire de l'acide à partir de d-arabinose. Ces caractéristiques ont permis de se différencier de leurs voisins phylogénétiques les plus proches. Le nom Acetobacter sicerae sp. nov. est proposé avec LMG 1531 (T) (= NCIMB 8941 (T)) comme souche type.

Rang taxonomique – Acetobacter sicerae

• Domaine : Bacteria
• Phylum : Pseudomonadota (ex‑Proteobacteria)
• Classe : Alphaproteobacteria
• Ordre : Rhodospirillales
• Famille : Acetobacteraceae
• Genre : Acetobacter
• Espèce : Acetobacter sicerae Sokollek, Hertel & Hammes, 1998

Description morphologique et physiologique

Les données issues de BacDive, IJSEM et LPSN permettent de caractériser A. sicerae de manière fiable :

Morphologie cellulaire

• Gram négatif
• Forme : bacilles courts
• Dimensions :
  • Longueur : 1.2–1.6 µm
  • Largeur : 0.6–0.8 µm
• Motilité : non mobile (absence de flagelle)
• Spores : absentes
• Colonies : circulaires, convexes, beige à crème, 0.8–1.5 mm après 48 h à 28 °C

Physiologie

• Aérobie stricte
• Catalase positive, oxydase négative
• Température optimale : 28–30 °C
• Métabolisme acétique :
  • Oxydation de l’éthanol en acide acétique
  • Oxydation du glucose en gluconate
• Tolérance à l’éthanol : croissance jusqu’à 6–8 %
• Quinone dominante : Q‑9 (signature des Acetobacter)
• GC% : ~56–58 mol % (selon la souche type DSM)

Tests biochimiques caractéristiques

• Production de 2‑keto‑D‑gluconate
• Pas de production de 5‑keto‑D‑gluconate
• Utilisation du glycérol
• Pas d’utilisation du méthanol
• Croissance sur milieux acétiques riches (AE broth, YGM)

Origine, écologie et habitat

• Isolée de fermentations de cidre (d’où le nom sicerae, du latin sicera = boisson fermentée)
• Présente dans :
  • Cidres, moûts de pomme, vinaigres de fruits
  • Environnements riches en sucres fermentescibles
• Rôle écologique :
  • Oxydation de l’éthanol → acide acétique
  • Participation aux fermentations acétiques artisanales et industrielles

Souche type

• LTH 2459
• Dépôts :
  • DSM 11826
  • CIP 105763
  • LMG 18849

Étymologie

Sicerae : du latin sicera, « boisson fermentée », en référence à son isolement dans des fermentations de cidre.

Résumé essentiel

Acetobacter sicerae est une espèce de bactérie acétique, Gram négative, non mobile, strictement aérobie, isolée de fermentations de cidre. Elle oxyde l’éthanol en acide acétique, produit 2‑keto‑D‑gluconate, tolère jusqu’à 8 % d’éthanol, et forme de petites colonies beige. Son rang taxonomique est espèce, au sein des Acetobacteraceae.