Acetobacter nitrogenifigens

Les quatre bactéries fixatrices d'azote décrites jusqu'à présent dans la famille des Acetobacteraceae appartiennent aux genres Gluconacetobacter et Acetobacter. La souche bactérienne fixatrice d'azote RG1 (T) a été isolée à partir de thé Kombucha et, sur la base de l'analyse phylogénétique de la séquence du gène de l'ARNr 16S qui repose sur une valeur bootstrap élevée, s'est révélée appartenir au genre Acetobacter. La souche RG1 (T) différait de Acetobacter aceti, le membre le plus proche présentant une similarité de séquence génique de l'ARNr 16S de 98,2%, et des souches types d'autres espèces d'Acetobacter en ce qui concerne plusieurs caractéristiques de caractéristiques de croissance dans les milieux de culture, croissance dans un milieu sans azote, production de gamma-pyrone à partir de glucose et de dihydroxyacétone à partir de glycérol. La souche RG1 (T) utilisait du maltose, du glycérol, du sorbitol, du fructose, du galactose, de l'arabinose et de l'éthanol, mais pas du méthanol en tant que source de carbone. Ces résultats, ainsi que les schémas de mobilité électrophorétique de neuf enzymes métaboliques, suggèrent que la souche RG1 (T) représente une nouvelle espèce fixatrice d'azote. L'ubiquinone présente était Q-9 et la teneur en ADN G + C était de 64,1% en moles. La souche RG1 (T) présentait une faible valeur de corrélation ADN-ADN de 2 à 24% avec les souches types des acétobacters apparentés, ce qui la plaçait comme un taxon séparé. Sur la base de ces données, le nom Acetobacter azoteifigens sp. nov. est proposé, avec la souche de type RG1 (T) (= MTCC 6912 (T) = LMG 23498 (T)).

Position taxonomique complète

• Domaine : Bacteria
• Phylum : Pseudomonadota (anciennement Proteobacteria)
• Classe : Alphaproteobacteria
• Ordre : Rhodospirillales
• Famille : Acetobacteraceae
• Genre : Acetobacter
• Espèce : Acetobacter nitrogenifigens Dutta & Gachhui 2006

Description morphologique et physiologique

• Gram : négatif
• Forme cellulaire : bacille (1,5–2,0 µm × 0,1–0,2 µm)
• Motilité : oui, flagelle polaire
• Métabolisme : aérobie strict
• Quinone principale : ubiquinone Q‑9
• Production de métabolites : 4H‑pyran‑4‑one, dihydroxyacétone

Caractéristiques écologiques et métaboliques

• Fixation de l’azote : espèce diazotrophe, capable de croître en milieu LGI sans azote.
• Isolation : Kombucha (thé fermenté) — souche type RG1.
• Sources de carbone utilisées : D‑arabinose, D‑fructose, D‑galactose, D‑mannitol, D‑sorbitol, D‑xylose, éthanol, L‑alanine, L‑cystéine, L‑phénylalanine, L‑thréonine…
• Tolérances : sucrose (30 %), glucose (30 %), éthanol (10 %).

Culture

• Milieux : LGI agar, LGI sans azote, potato agar.
• Colonies : circulaires, 2–3 mm, transparentes ou jaune/brun selon le milieu.
• Température de croissance : ~30 °C.

Résumé essentiel

Acetobacter nitrogenifigens est une espèce de bactérie acétique, Gram négative, aérobie stricte, motile, isolée du Kombucha. Elle se distingue par sa capacité de fixation de l’azote, sa croissance en milieu dépourvu d’azote, et son profil métabolique large incluant l’oxydation de l’éthanol et la production de composés comme la dihydroxyacétone.