Acetobacter okinawensis
Au Japon, onze souches de bactéries d'acide acétique ont été isolées à partir de tiges de canne à sucre, de fruits et d'une fleur. Les isolats ont été séparés en trois groupes, groupes I, II et III, dans le genre Acetobacter, selon une analyse phylogénétique basée sur les séquences d'ARNr 16S. Les isolats présentaient des similitudes de séquence de 99,8 à 100% dans le groupe, de 99,3 à 99,6% avec ceux des souches types de chaque espèce apparentée d’Acetobacter et moins de 98,4% avec ceux des souches types d’autres espèces d’Acetobacter. Les teneurs en ADN génomique G + C des groupes I, II et III étaient respectivement de 59,2-59,4, 60,5-60,7 et 58,7-58,9% en moles. Les isolats du groupe présentaient des valeurs élevées de corrélation entre ADN et ADN, mais des valeurs faibles inférieures à 46% aux souches types d'espèces apparentées d'Acetobacter. Une bonne corrélation a été trouvée entre les trois groupes et les groupes basés sur le contenu en ADN G + C et le rapport ADN-ADN Le Q-9 était le composant principal de toutes les souches et les Q-8 et Q-10 l’étaient comme composants mineurs. Les isolats des trois groupes ne correspondaient complètement à aucune espèce d’Acetobacter lors de la réaction de la catalase, de la production d’acides cétogluconiques à partir de D-glucose, de la croissance sur azote ammoniacal avec de l’éthanol (milieu Hoyer-Frateur et milieu de Hoyer modifié Frateur), croissance de 30% (p / v) D-glucose, croissance dans l’éthanol à 10% (v / v) ou teneur en ADN G + C. Sur la base des relations phylogénétiques dans le genre Acetobacter et des caractéristiques chimosystématiques et phénotypiques, les trois groupes ont été considérés comme une nouvelle espèce dans le genre Acetobacter. Acetobacter okinawensis sp. nov. est proposé pour le groupe I, Acetobacter papayae sp. nov. pour le groupe II et Acetobacter persicus sp. nov. pour le groupe III.
Position taxonomique complète
- Domaine : Bacteria
- Phylum : Pseudomonadota (anciennement Proteobacteria)
- Classe : Alphaproteobacteria
- Ordre : Rhodospirillales
- Famille : Acetobacteraceae
- Genre : Acetobacter
- Espèce : Acetobacter okinawensis Iino et al. 2013
Description morphologique, physiologique et écologique
Acetobacter okinawensis est une bactérie acétique (AAB), Gram négative, isolée initialement de tiges de canne à sucre, fruits et une fleur au Japon. Elle présente les caractéristiques suivantes :
- Quinones : Q‑9 comme quinone principale (Q‑8 et Q‑10 mineures)
- GC% : 59,2–59,4 mol% selon les souches du groupe I
- Température de croissance : optimale autour de 30 °C
- Métabolisme : oxydation de l’éthanol en acide acétique (typique des Acetobacter)
- Type strain : 1‑35 ; JCM 25146 ; LMG 26457
- Séquence 16S rRNA : AB665068 / AB665072 selon les isolats
- Isolement documenté : également isolée de raisin (Vitis vinifera) à Tottori (Japon, 2007)
Contexte taxonomique et publication
L’espèce a été décrite dans l’étude de Iino et al. (2012), qui a identifié trois groupes de bactéries acétiques nouvelles sur la base de la phylogénie 16S, du contenu en GC et de la chimie des quinones. Acetobacter okinawensis correspond au Groupe I, proposé comme espèce nouvelle (sp. nov.). La validation nomenclaturale a été publiée dans la Validation List n°149 (2013).
Résumé essentiel
Acetobacter okinawensis est une espèce de bactérie acétique du genre Acetobacter, caractérisée par un profil quinonique Q‑9, un GC% autour de 59 %, et isolée de plantes (canne à sucre, fruits, raisin) au Japon. Elle est validement publiée et phylogénétiquement bien définie au sein des Acetobacteraceae.