Ustilaginomycetes
Les Ustilaginomycetes sont l'une des quatre principales classes de Basidiomycota et contiennent environ 1 500 espèces (Kirk et al., 2001). Dans sa forme actuelle telle que circonscrite par Begerow et al. (1997) et Bauer et al. (1997, 2001), ce groupe est monophylétique. Les Ustilaginomycetes producteurs d'hypha sont unis par leur mode de vie en tant qu'agents pathogènes végétaux écologiquement obligatoires, souvent avec une phase de levure supplémentaire en liberté (saprotrophe). Ils peuvent être distingués des champignons de la rouille en ce que les haustoria sont soit totalement absents, soit, lorsqu'ils sont présents, prennent la forme d'hyphes intracellulaires simples ou d'extensions hyphales qui invaginent le plasmalemme hôte mais ne sont pas différenciés en un cou étroit et un corps haustorial plus large. De plus, les hyphes intracellulaires d'Ustilaginomycetes sécrètent généralement une gaine épaisse qui est facilement visible par microscopie électronique à transmission. Les septas sont soit dépourvues de perforations, soit contiennent de simples pores ou dolipores qui sont similaires à ceux des Uredinomycetes chez les parents disparus. Les véritables connexions de pince ne sont généralement pas trouvées. Les basidies des champignons du smut produisent de nombreuses basidiospores tandis que celles de champignons rouilles ne produisent généralement que quatre.
La classe Ustilaginomycetes a été divisée en trois sous-classes par Begerow et al. (1997, 2000). Nous examinerons les représentants de deux d'entre eux. Les Ustilaginomycetidae sont les Ustilaginomycètes les plus pathogènes pour les plantes, provoquant des symptômes similaires à ceux de la plante. Les membres typiques des Exobasidiomycetidae provoquent d'autres maladies biotrophiques et se distinguent de la première en produisant des basidies directement à partir de mycélium parasites, et non de téliospores.