Liste de phytovirus.

Liste de phytovirus

Liste de phytovirus (virus s'attaquant aux organismes végétaux) classé par familles et par genres.

La taxinomie des virus phytopathogènes (virus de plantes) est fondée, comme pour toutes les familles et genres de virus, sur des critères de différenciation taxinomiques essentiels qui sont la présence ou l'absence d'une enveloppe virale, la symétrie de la capside (structure qui entoure le génome) et la nature du génome. L'acide nucléique qui constitue le génome présent dans le virion, peut être constitué d'ARN (RNA, la très grande majorité) ou d'ADN (DNA), dont la forme peut être linéaire ou circulaire, segmentée ou non segmentée ; la structure de l'acide nucléique peut être monocaténaire (à simple brin, ss) ou bicaténaire (à double brin, ds). Selon la polarité de l'acide nucléique à simple brin, on distingue des génomes à polarité négative ss (-), positive ss (+) et ambisens ss (-/+). Chez certains virus de plantes, lors de la propagation par une transcriptase inverse (RT), l'ARN est transcrit en ADN.

La plupart des familles énumérées ci-dessous ne comprennent que des virus affectant les plantes, seules quatre familles (et huit genres) : Reoviridae (Fijivirus, Oryzavirus, Phytoreovirus), Rhabdoviridae (Cytorhabdovirus, Nucleorhabdovirus, Tenuivirus), Tymoviridae (Marafivirus), Tospoviridae (Orthotospovirus), comprennent aussi des espèces de virus des animaux[1]. Plusieurs genres de virus des végétaux ne sont pas encore, selon les dispositions de l'ICTV, rattachés à une famille (non classés).

Liste des genres classés par familles

Selon ICTV.

Groupe

Famille

Sous-famille

Genre

Génome

Enveloppe virale

Symétrie / Forme

Royaume : Riboviria

IV

Alphaflexiviridae

Allexivirus, Lolavirus, Mandarivirus, Platypuvirus, Potexvirus,

ss (+) RNA

Absente

En hélice, filamenteux

III

Amalgaviridae

Amalgavirus

dsRNA

Absente

V

Aspiviridae

Ophiovirus

ss (-) RNA, segmenté (3-4)

Absente

En hélice, filamenteux

IV

Benyviridae

Benyvirus

ss (+) RNA, segmenté (4-5)

Absente

En hélice, en bâtonnet

IV

Betaflexiviridae

Quinvirinae

Carlavirus, Foveavirus, Robigovirus

ss (+) RNA

Absente

En hélice, filamenteux

Trivirinae

Capillovirus, Chordovirus, Citrivirus, Divavirus, Prunevirus, Ravavirus, Tepovirus, Trichovirus, Vitivirus, Wamavirus

IV

Botourmiaviridae

Ourmiavirus

ss (+) RNA, segmenté (3)

Absente

Icosaédrique, bacilliforme

IV

Bromoviridae

Alfamovirus, Anulavirus, Bromovirus, Cucumovirus, Ilarvirus, Oleavirus

ss (+) RNA, segmenté (3)

Absente

Icosaédrique, sphérique à bacilliforme

VII

Caulimoviridae

Badnavirus, Caulimovirus, Cavemovirus, Dioscovirus, Petuvirus, Rosadnavirus, Solendovirus Soymovirus, Tungrovirus, Vaccinivirus

dsDNA (RT), circulaire

Absente

Icosaédrique, bacilliforme

III

Chrysoviridae

Alphachrysovirus

ds (+) RNA, linéaire, segmenté (3-4)

Absente

Icosaédrique

IV

Closteroviridae

Ampelovirus, Closterovirus, Crinivirus, Velarivirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

En hélice, filamenteux

IV

Endornaviridae

Alphaendornavirus

dsRNA (+), linéaire

V

Fimoviridae

Emaravirus

ss (-) RNA, segmenté (2)

Absente

En hélice, en bâtonnet

IV

Kitaviridae

Blunervirus, Cilevirus, Higrevirus

Ss RNA (+), linéaire

IV

Mayoviridae

Idaeovirus, Pteridovirus

Ss RNA (+), linéaire

VI

Metaviridae

Metavirus

Ss RNA-RT

III

Partitiviridae

Alphapartitivirus, Betapartitivirus, Deltapartitivirus

Ds RNA, segmenté (2)

Absente

Icosaédrique, sphérique

V

Phenuiviridae

Coguvirus, Rubodvirus, Tenuivirus

Ss (+/-) RNA et (-) RNA, segmenté (4-6)

Absente

Filamenteux

IV

Potyviridae

Arepavirus, Bevemovirus, Brambyvirus, Bymovirus, Celavirus, Ipomovirus, Macluravirus, Poacevirus, Potyvirus, Roymovirus, Rymovirus, Tritimovirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

En hélice, filamenteux

VI

Pseudoviridae

Pseudovirus, Sirevirus

Ss RNA (RT)

Icosaédrique, sphérique

III

Reoviridae

Sedoreovirinae

Phytoreovirus

Ds RNA, segmenté (10-12)

Absente

Icosaédrique, sphérique

Spinareovirinae

Fijivirus, Oryzavirus

V

Rhabdoviridae

Alphanucleorhabdovirus, Betanucleorhabdovirus, Cytorhabdovirus, Dichorhavirus, Gammanucleorhabdovirus, Varicosavirus

Ss (-) RNA, linéaire

Présente

En hélice, bacilliforme

IV

Secoviridae

Cheravirus, Sadwavirus, Sequivirus, Torradovirus, Waikavirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

Icosaédrique, sphérique

Comovirinae

Comovirus, Fabavirus, Nepovirus

IV

Solemoviridae

Polemovirus, Sobemovirus, Polerovirus, Enamovirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

Icosaédrique, sphérique

IV

Tombusviridae

Calvusvirinae

Umbravirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

Icosaédrique, sphérique

Procedovirinae

Alphacarmovirus, Alphanecrovirus, Aureusvirus, Avenavirus, Betacarmovirus, Betanecrovirus, Gallantivirus, Gammacarmovirus, Macanavirus, Machlomovirus, Panicovirus, Pelarspovirus, Tombusvirus, Zeavirus, Luteovirus

Regressovirinae

Dianthovirus

V

Tospoviridae

Orthotospovirus

Ss (-/+) RNA et (-) RNA, segmenté (3)

Présente

Icosaédrique, sphérique

IV

Tymoviridae

Tymovirus, Marafivirus, Maculavirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

Icosaédrique, sphérique

IV

Virgaviridae

Furovirus, Goravirus, Hordeivirus, Pomovirus, Pecluvirus, Tobamovirus, Tobravirus

Ss (+) RNA, segmenté (3)

Absente

En hélice, en bâtonnet

IV

Incertae sedis

Albetovirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

En hélice, en bâtonnet

IV

Incertae sedis

Aumaivirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

En hélice, en bâtonnet

IV

Incertae sedis

Papanivirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

En hélice, en bâtonnet

IV

Incertae sedis

Virtovirus

Ss (+) RNA, linéaire

Absente

En hélice, en bâtonnet

Royaume : Monodnaviria

II

Geminiviridae

Becurtovirus, Begomovirus, Capulavirus, Curtovirus, Eragrovirus, Grablovirus, Mastrevirus, Topocuvirus, Turncurtovirus

Ss (+/-) DNA, circulaire, segmenté (1-2)

Absente

icosaédrique, sphérique

II

Genomoviridae

Gemycircularvirus

Ss (+) DNA

Absente

icosaédrique, sphérique

II

Nanoviridae

Nanovirus, Babuvirus

Ss (+) DNA, circulaire, segmenté (6-9)

Absente

icosaédrique, sphérique

Viroïdes

Viroïdes

Avsunviroidae

Avsunviroid, Elaviroid, Pelamoviroid

Ss RNA

Absente

Viroïdes

Pospiviroidae

Apscaviroid, Cocadviroid, Coleviroid, Hostuviroid, Pospiviroid

Ss RNA

Absente

Date de dernière mise à jour : 16/09/2026

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