Planctomycetota - Planctomycetacia
Les Planctomycetota (anc. Planctomycetes), en français les Planctomycètes, sont un phylum du règne des Pseudomonadati au sein du domaine Bacteria. Son nom provient de Planctomyces qui est le genre type de ce phylum.
Ce sont des bactéries aquatiques qui se trouvent dans des terrains saumâtres, marins ou d'eau douce, mais aussi des bactéries terrestres qui jouent un rôle important dans le processus anammox. Elles se reproduisent par bourgeonnement. La structure des organismes de ce groupe est ovoïde avec une tige, à la terminaison non-reproductive, qui les aide à se joindre les uns aux autres au cours du bourgeonnement.
Planctomycetacia (souvent orthographié Planctomycetia) est la plus grande classe du phylum Planctomycetota (anciennement Planctomycetes), un groupe de bactéries du super‑phylum PVC (Planctomycetota–Verrucomicrobiota–Chlamydiota). Ce sont des bactéries aérobies, hétérotrophes, à organisation cellulaire très atypique, connues pour leur division par bourgeonnement, leurs membranes internes complexes, et l’absence ou l’atypie du peptidoglycane.
Identité taxonomique
- Domaine : Bacteria
- Règne : Pseudomonadati
- Phylum : Planctomycetota
- Classe : Planctomycetia / Planctomycetacia
- Classes voisines : Phycisphaerae, Ca. Brocadiae (anammox).
Caractéristiques cellulaires majeures
- Didermes atypiques (Gram‑négatif modifié).
- Peptidoglycane absent ou atypique, remplacé par des glycoprotéines riches en glutamate.
- Organisation interne compartimentée :
- Riboplasme / pirellulosome (ribosomes + protéines)
- Paryphoplasme (compartiment sans ribosomes)
- Parfois nucléoïde entouré d’une double membrane, évoquant une proto‑compartimentation eucaryote.
- Division par bourgeonnement, non par fission binaire.
- Endocytose‑like : capacité rare chez les bactéries à internaliser des macromolécules.
- Stérols : certaines espèces synthétisent des stérols, trait exceptionnel chez les procaryotes.
Écologie et habitats
- Présents dans milieux aquatiques (marins, saumâtres, eau douce) et terrestres (sols, tourbières, biofilms).
- Très fréquents dans les biofilms marins (jusqu’à 80 % de la biomasse microbienne dans certains biofilms).
- Associations avec macroalgues, éponges, plantes aquatiques.
- Rôle écologique majeur : dégradation de polysaccharides complexes (cellulose, chitine, polysaccharides sulfatés), cycle du carbone et du soufre.
Génomes et métabolisme
- Génomes volumineux : médiane ~4,8 Mb, pouvant dépasser 8,6 Mb.
- GC élevé (>50 %).
- Très nombreux gènes inconnus, protéines géantes (>5 kb).
- Abondance de CAZymes et sulfatases → dégradation de polymères récalcitrants.
- Production potentielle de métabolites bioactifs (NRPS, PKS).
- Résistance aux β‑lactamines (faible dépendance au peptidoglycane).
Morphologie et cycle de vie
- Cellules sphériques, parfois stalkées (tige + holdfast adhésif).
- Dimorphisme :
- Cellule sessile fixée, bourgeonnante
- Cellule swarmer flagellée, mobile → Cycle permettant colonisation + maintien en zones riches en nutriments.
Organisation taxonomique interne
Selon les classifications récentes :
- ≈ 150 espèces décrites
- 11 ordres, 18 familles, 87 genres Ordres représentatifs : Planctomycetales, Pirellulales, Isosphaerales, Gemmatales.
Importance évolutive
Les Planctomycetia sont souvent considérés comme un groupe clé pour comprendre l’évolution de la compartimentation cellulaire chez les procaryotes, en raison de :
- Leurs membranes internes complexes,
- La présence de protéines de type “membrane coat” analogues à celles des eucaryotes,
- Leur endocytose‑like.
En résumé
Planctomycetacia / Planctomycetia = → Bactéries hautement atypiques, compartimentées, bourgeonnantes, à paroi non conventionnelle, écologiquement essentielles dans les biofilms et la dégradation de polymères complexes. → Un groupe fascinant pour la microbiologie évolutive, la biotechnologie et l’écologie microbienne.