Chlorobiota – chlorobi.

Chlorobiota – chlorobi

Chlorobi = un phylum bactérien valide Le terme Chlorobi correspond au rang taxonomique de phylum dans le domaine Bacteria. Le nom moderne validé dans les classifications récentes (GTDB, LPSN) est Chlorobiota.

Les Chlorobiota sont un phylum du règne des Pseudomonadati au sein du domaine Bacteria. Son nom provient de Chlorobium qui est le genre type de ce phylum.

Rang taxonomique complet

• Domaine : Bacteria
• Phylum : Chlorobiota (synonyme historique : Chlorobi)
• Classe : Chlorobia
• Ordre : Chlorobiales
• Famille : Chlorobiaceae
• Genres principaux : Chlorobium, Prosthecochloris, Pelodictyon, Chlorobaculum

Description scientifique

Les Chlorobi sont les célèbres bactéries vertes sulfureuses, un groupe phototrophe anoxygénique très ancien.

Caractéristiques générales

• Bactéries Gram négatives
• Phototrophes anoxygéniques (ne produisent pas d’oxygène)
• Utilisent des bactériochlorophylles c, d, e
• Présence de chlorosomes, organites photosynthétiques uniques
• Oxydent des sulfures (H₂S) ou du soufre comme donneurs d’électrons
• Anaérobies stricts
• Habitats : zones stratifiées, anoxiques, riches en sulfures (lacs, sédiments, sources chaudes)

Chlorobiota

Les Chlorobiaceae qui croissent en bas de cette colonne de Winogradsky font partie du phylum des Chlorobiota.

Phylum

Chlorobiota
Iino et al. 2021

Synonymes

• Ignavibacteriota Podosokorskaya et al. 2021
• Chlorobiota Whitman et al. 2018
• Ignavibacteriota Whitman et al. 2018
• Chlorobaeota Oren et al. 2015
• Ignavibacteraeota Oren et al. 2015
• Ignavibacteriae Podosokorskaya et al. 2013
• Chlorobi Iino et al. 2010
• Chlorobi Garrity & Holt 2001

Historique

Ce phylum est proposé dès 2010 par Iino sous le nom de Chlorobi pour contenir deux classes de bactéries à Gram négatif strictement anaérobies, les Chlorobea et les Ignavibacteria. Cette création est proposée à la suite de la description de l'espèce Ignavibacterium album isolée à Yumata (Nagano, Japon). Il avait alors été établi que son ordre type était les Chlorobiales. En 2018, il a été proposé que le nom devienne Chlorobiota avec la classe Chlorobia comme classe type.

En 2021, ce nom du phylum est effectivement publié de manière valide par Oren et Garrity après un renommage conforme au code de nomenclature bactérienne. Le nom d'auteur de ce phylum (Iino) et qui fait autorité, diffère volontairement du nom des auteurs de l'article de la publication valide (Oren et Garrity). Dans le même temps, ces auteurs proposent aussi le nom de Ignavibacteriota comme nom de phylum publié de manière valide pour contenir les Ignavibacterium comme genre type. Ce dernier phylum est désormais considéré comme un synonyme hétérotypique du phylum Chlorobiota.

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de ce phylum Chlorobiota est la suivante : Chlo.ro.bi.o’ta N.L. neut. n. Chlorobium, genre type de ce phylum ; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum ; N.L. neut. pl. n. Chlorobiota, le phylum des Chlorobium.

Phylogénie

Le phylum Chlorobiota a été défini dès 2010 sur la base du séquençage de l'ARNr 16S.

Liste de classes

Selon la LPSN (22 avril 2025) ce phylum comporte deux classes publiées de manière valide :

• Chlorobiia corrig. Garrity & Holt 2022
• Ignavibacteria Iino et al. 2010

Photosynthèse des Chlorobi

Les Chlorobi réalisent une photosynthèse anoxygénique :

• Pas de production d’O₂
• Utilisation de sulfure d’hydrogène (H₂S)
• Pigments logés dans des chlorosomes, structures très efficaces pour capter la lumière faible
• Adaptation aux milieux très pauvres en lumière (zones profondes des lacs)

Genres importants

Chlorobium

• Le genre type
• Bactéries vertes sulfureuses classiques
• Présentes dans les zones anoxiques stratifiées

Prosthecochloris

• Formes marines
• Pigments variés (bactériochlorophylle e)

Chlorobaculum

• Espèces thermophiles
• Sources chaudes et environnements extrêmes

Différence avec les Chloroflexi

Tu m’avais demandé récemment les Chloroflexi :

• Chlorobi = bactéries vertes sulfureuses (phototrophes anoxygéniques, chlorosomes, sulfures)
• Chloroflexi = bactéries vertes non sulfureuses (phototrophes facultatives, filamenteuses, thermophiles)

Deux phyla totalement différents malgré le nom proche.

Résumé essentiel

• Chlorobi = phylum Chlorobiota
• Bactéries phototrophes anoxygéniques
• Utilisent H₂S comme donneur d’électrons
• Possèdent des chlorosomes (structures uniques)
• Habitats : milieux anoxiques, sulfureux, souvent stratifiés
• Genres : Chlorobium, Prosthecochloris, Chlorobaculum