Actinomycetota – Actinobacteria
Actinobacteria — Description et rang taxonomique
Les Actinomycetota (anc. Actinobacteria) sont un phylum du règne des Bacillati au sein du domaine Bacteria. Son nom provient de Actinomyces qui est le genre type de ce phylum.
Actinomycetota
Phylum

Actinomycetota
Goodfellow (en) 2021
Synonymes
- Actinobacteria (ex Margulis 1974) Cavalier-Smith 2020
- Actinobacteriota Whitman et al. 2018
- Actinobacteraeota Oren et al. 2015
- Actinobacteria Goodfellow 2012
Rang taxonomique
- Domaine : Bacteria
- Règne : Bacillati
- Phylum : Actinomycetota
- Synonymes historiques :
- Actinobacteria (nom abandonné)
- Actinobacteriota (usage transitoire)
- Classe type : Actinomycetes
- Genre type : Actinomyces Harz 1877
Description scientifique du phylum Actinomycetota
Les Actinomycetota regroupent des bactéries Gram positif, à fort pourcentage de GC, souvent filamenteuses, et responsables de la production de la majorité des antibiotiques naturels.
Caractères généraux
- Gram positif
- %GC élevé (55–75 %)
- Filamenteuses ou coccoïdes selon les ordres
- Production de géosmine (odeur de terre humide)
- Présence d’acides mycoliques dans certains groupes (Mycobacteriales, Corynebacteriales)
- Nombreuses espèces saprophytes, symbiotiques, commensales ou pathogènes
Morphologie
- Hyphes fins, parfois ramifiés
- Spores chez les Streptomycetales
- Paroi riche en peptidoglycane, souvent avec acides diaminés spécifiques (DAP, lysine, glycine)
Métabolisme
- Aérobies ou anaérobies facultatives
- Dégradation de substrats complexes (cellulose, chitine)
- Production d’antibiotiques naturels (streptomycine, érythromycine, etc.)
Taxonomie
Ce phylum est proposé dès 2012 par M. Goodfellow (en) dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology sous le nom de « Actinobacteria ». Ce n'est qu'en 2021 qu'il est publié de manière valide par Oren et Garrity après un renommage conforme au code de nomenclature bactérienne (le nom du phylum devant être dérivé de celui de son genre type, en l'occurrence Actinomyces, par adjonction du suffixe -ota conformément à une décision de l'ICSP en 2021).
Liste de classes
Selon la LPSN (12 avril 2025) ce phylum contient six classes publiées de manière valide :
"Candidatus"
Selon la LPSN (12 avril 2025), trois classes candidatus ont été décrites mais leur nom est invalide car elles n'ont pas été publiées de manière conforme au Code International de Nomenclature Bactérienne :
- « Ca. Aquicultoria » Jiao et al. 2021
- « Ca. Geothermincolia » Jiao et al. 2021
- « Ca. Humimicrobiia » Jiao et al. 2021
Ordres principaux du phylum Actinomycetota
(Classification LPSN / GTDB 2025)
- Streptomycetales
- Mycobacteriales
- Micrococcales
- Propionibacteriales
- Bifidobacteriales
- Nocardiales
- Pseudonocardiales
- Frankiales
- Micromonosporales
- Kitasatosporales
- Glycomycetales
- Catenulisporales
- Acidothermales
- Sporichthyales
Habitat
- Sols (groupe dominant dans l’humus)
- Sédiments
- Microbiotes animaux (ex. Bifidobacterium)
- Environnements extrêmes (acidophiles, thermophiles)
Importance écologique et médicale
Écologie
- Décomposition de la matière organique
- Fixation d’azote (ex. Frankia)
- Production de géosmine (odeur de terre après la pluie)
Médecine
- Pathogènes majeurs :
- Mycobacterium tuberculosis
- Mycobacterium leprae
- Nocardia spp.
- Corynebacterium diphtheriae
Biotechnologies
- Production de la majorité des antibiotiques naturels
- Enzymes industrielles
- Métabolites secondaires complexes
Résumé essentiel
- Actinomycetota = phylum valide des Actinobacteria
- Bactéries Gram+, haut %GC, souvent filamenteuses
- Groupe majeur du sol, très diversifié
- Importance écologique, médicale et biotechnologique
- Comprend Streptomyces, Mycobacterium, Actinomyces, Bifidobacterium