Dickeya.

Dickeya

(Pectobacteriaceae)

Dickeya est un genre de bactéries phytopathogènes très agressives, responsables de pourritures molles, blackleg et nécroses sur de nombreuses plantes cultivées. Elles appartiennent à la famille des Pectobacteriaceae et étaient autrefois classées dans le genre Erwinia.

Dickeya est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Pectobacteriaceae. Son nom fait référence au phytopathologiste R.S. Dickey en hommage à ses contributions concernant l'étude du « complexe Erwinia chrysanthemi ».

Plusieurs espèces sont des phytopathogènes notoires.

Dickeya

Genre

Dickeya
Samson et al. 2005

Taxonomie

Ce genre a été créé en 2005 par reclassement des espèces Pectobacterium chrysanthemi et Brenneria paradisiaca déjà comptées dans la famille des Pectobacteriaceae.

Jusqu'en 2016 il était compté parmi les Enterobacteriaceae auquel il était rattaché sur la base de critères phénotypiques. Depuis la refonte de l'ordre des Enterobacterales en 2016 par Adeolu et al. à l'aide des techniques de phylogénétique moléculaire, il a été déplacé vers la famille des Pectobacteriaceae nouvellement créée.

Identité et caractéristiques clés

• Bactéries Gram négatives, bacilles mobiles à flagelles péritriches (ex. Dickeya dadantii) .
• Pathogènes “brute force” : production massive de pectate lyases et autres pectinases, enzymes qui liquéfient les parois cellulaires végétales et provoquent la pourriture molle.
• Large spectre d’hôtes : plantes horticoles, cultures vivrières, arbres fruitiers, plantes ornementales.
• Distribution mondiale : climats tropicaux, subtropicaux et tempérés.

Espèces importantes

• Dickeya solani : espèce émergente en Europe, très agressive sur la pomme de terre ; détectée dans les semences européennes depuis 2004.
• Dickeya dianthicola : établie aux États‑Unis depuis 2016 ; fréquente en pomme de terre et plantes ornementales.
• Dickeya dadantii : très polyphage ; provoque nécroses, flétrissements et pourritures molles sur de nombreuses familles végétales (Solanacées, Brassicacées, Orchidacées, etc.).

Cycle et mécanisme de pathogénie

• Entrée par les blessures ou tissus affaiblis.
• Phase asymptomatique initiale, puis multiplication rapide dans les tissus.
• Sécrétion via le système Out : export massif de pectinases qui dégradent la paroi végétale et libèrent les nutriments pour la bactérie.
• Conditions favorables : humidité élevée, températures chaudes (Dickeya tolère des températures plus élevées que d’autres agents du blackleg).

Symptômes typiques

• Pourriture molle aqueuse et odeur forte.
• Lésions noires et visqueuses sur tiges (aspect “blackleg”).
• Jaunissement, flétrissement, dessèchement des tiges en conditions sèches.
• Pourriture des tubercules de pomme de terre.

Gestion et prévention

Il n’existe pas de contrôle chimique efficace (antibiotiques interdits en agriculture). Les mesures reposent sur :

• Hygiène stricte du matériel : lavage/désinfection avant coupe, plantation, récolte.
• Semences certifiées et inspection des tubercules.
• Rotation culturale, élimination des tas de déchets (“cull piles”).
• Drainage du sol et gestion de l’irrigation pour éviter l’eau stagnante.
• Diagnostic rapide en laboratoire en cas de symptômes.

Pourquoi Dickeya est un problème majeur ?

• Très agressive, plus que les autres bactéries du blackleg.
• Propagation rapide via semences, eau, outils, parfois insectes.
• Impact économique élevé : pertes de rendement, dégradation de la qualité des tubercules et plantes horticoles.

Liste d'espèces

Selon la LPSN (26 octobre 2022) :

• Dickeya aquatica Parkinson et al. 2014
• Dickeya chrysanthemi (Burkholder et al. 1953) Samson et al. 2005 – espèce type
• Dickeya dadantii Samson et al. 2005
• Dickeya dianthicola Samson et al. 2005
• Dickeya fangzhongdai Tian et al. 2016
• Dickeya lacustris Hugouvieux-Cotte-Pattat et al. 2019
• Dickeya oryzae Wang et al. 2020
• Dickeya parazeae Hugouvieux-Cotte-Pattat & Van Gijsegem 2021
• Dickeya poaceiphila Hugouvieux-Cotte-Pattat et al. 2020
• Dickeya solani van der Wolf et al. 2014
• Dickeya undicola Oulghazi et al. 2019
• Dickeya zeae Samson et al. 2005

Les espèces suivantes ont été reclassées :

• Dickeya dadantii subsp. dieffenbachiae (Samson et al. 2005) Brady et al. 2012 : reclassement de D. dieffenbachiae
• Musicola paradisiaca (Fernandez-Borrero & Lopez-Duque 1970) Hugouvieux-Cotte-Pattat et al. 2021 : reclassement de D. paradisiaca

Plantes hôtes

Le tableau suivant indique une correspondance entre certaines espèces et leurs plantes hôtes.